Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms