Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SERPINB3P29508 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms