Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPREP23469 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPREP23469 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPREP23469 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPREP23469 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPREP23469 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPREP23469 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPREP23469 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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