Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms