Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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