Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XBP1P17861 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XBP1P17861 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XBP1P17861 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
XBP1P17861 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
XBP1P17861 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
XBP1P17861 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
XBP1P17861 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
XBP1P17861 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XBP1P17861 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XBP1P17861 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XBP1P17861 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XBP1P17861 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XBP1P17861 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
XBP1P17861 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XBP1P17861 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XBP1P17861 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms