Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms