Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GLI3P10071 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GLI3P10071 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GLI3P10071 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GLI3P10071 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GLI3P10071 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GLI3P10071 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GLI3P10071 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GLI3P10071 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GLI3P10071 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GLI3P10071 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GLI3P10071 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GLI3P10071 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GLI3P10071 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GLI3P10071 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GLI3P10071 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GLI3P10071 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GLI3P10071 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms