Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI2P10070 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI2P10070 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI2P10070 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI2P10070 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI2P10070 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI2P10070 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI2P10070 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI2P10070 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms