Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TFPTP0C1Z6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TFPTP0C1Z6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms