Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSLP07711 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSLP07711 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms