Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA4P06727 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms