Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4FO95754 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4FO95754 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4FO95754 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4FO95754 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4FO95754 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4FO95754 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4FO95754 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4FO95754 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4FO95754 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4FO95754 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms