Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE6O95741 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE6O95741 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE6O95741 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms