Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCTN3O75935 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms