Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms