Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NBNO60934 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NBNO60934 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NBNO60934 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NBNO60934 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NBNO60934 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NBNO60934 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NBNO60934 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NBNO60934 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NBNO60934 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NBNO60934 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NBNO60934 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NBNO60934 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NBNO60934 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NBNO60934 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NBNO60934 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NBNO60934 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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