Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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