Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 315.9 ms