Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM38O00635 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM38O00635 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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