Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms