Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YYE9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YYE9 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0J9YYE9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms