Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PARP3Q9Y6F1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP3Q9Y6F1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PARP3Q9Y6F1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms