Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CD2APQ9Y5K6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD2APQ9Y5K6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms