Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
WASHC2CQ9Y4E1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
WASHC2CQ9Y4E1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
WASHC2CQ9Y4E1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
WASHC2CQ9Y4E1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
WASHC2CQ9Y4E1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
WASHC2CQ9Y4E1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
WASHC2CQ9Y4E1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms