Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GNEQ9Y223 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GNEQ9Y223 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms