Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA3Q9XRX5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HHLA3Q9XRX5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HHLA3Q9XRX5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA3Q9XRX5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA3Q9XRX5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA3Q9XRX5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms