Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF8Q9UPN6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms