Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FZD1Q9UP38 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FZD1Q9UP38 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FZD1Q9UP38 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms