Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPDR1Q9UM22 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPDR1Q9UM22 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms