Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNRF3Q9ULT6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms