Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRID1Q9ULK0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms