Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA11Q9UKX5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA11Q9UKX5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA11Q9UKX5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA11Q9UKX5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA11Q9UKX5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA11Q9UKX5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA11Q9UKX5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA11Q9UKX5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA11Q9UKX5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms