Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms