Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFMBT1Q9UHJ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SFMBT1Q9UHJ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms