Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP2Q9UHC6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms