Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFDP1Q9UEE9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
CFDP1Q9UEE9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms