Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM4

OPTC, Opticin, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTCQ9UBM4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
OPTCQ9UBM4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OPTCQ9UBM4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPTCQ9UBM4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 311.1 ms