Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN10Q9UBB4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN10Q9UBB4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN10Q9UBB4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms