Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
REREQ9P2R6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
REREQ9P2R6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms