Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHPF2Q9P2E5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms