Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0N8

MARCH2, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH2, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH2Q9P0N8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH2Q9P0N8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH2Q9P0N8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH2Q9P0N8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH2Q9P0N8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH2Q9P0N8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH2Q9P0N8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH2Q9P0N8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms