Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKD2L1Q9P0L9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms