Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYOFQ9NZM1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYOFQ9NZM1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYOFQ9NZM1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYOFQ9NZM1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYOFQ9NZM1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYOFQ9NZM1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MYOFQ9NZM1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYOFQ9NZM1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYOFQ9NZM1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYOFQ9NZM1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYOFQ9NZM1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYOFQ9NZM1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYOFQ9NZM1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MYOFQ9NZM1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms