Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf78Q9NZ63 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
C9orf78Q9NZ63 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C9orf78Q9NZ63 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms