Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MIS18AQ9NYP9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MIS18AQ9NYP9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MIS18AQ9NYP9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MIS18AQ9NYP9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MIS18AQ9NYP9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MIS18AQ9NYP9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MIS18AQ9NYP9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MIS18AQ9NYP9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MIS18AQ9NYP9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MIS18AQ9NYP9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MIS18AQ9NYP9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MIS18AQ9NYP9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MIS18AQ9NYP9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MIS18AQ9NYP9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MIS18AQ9NYP9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
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