Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A1Q9NY26 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A1Q9NY26 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC39A1Q9NY26 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms