Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX58

LYAR, Cell growth-regulating nucleolar protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYARQ9NX58 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYARQ9NX58 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYARQ9NX58 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYARQ9NX58 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYARQ9NX58 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LYARQ9NX58 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LYARQ9NX58 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LYARQ9NX58 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LYARQ9NX58 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LYARQ9NX58 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYARQ9NX58 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYARQ9NX58 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms