Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT4Q9NX09 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDIT4Q9NX09 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms