Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF19AQ9NV58 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF19AQ9NV58 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF19AQ9NV58 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF19AQ9NV58 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF19AQ9NV58 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF19AQ9NV58 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF19AQ9NV58 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF19AQ9NV58 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF19AQ9NV58 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF19AQ9NV58 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF19AQ9NV58 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF19AQ9NV58 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms